Kėdainių žemės paviršių suformavo ledynai. Dabartinis reljefas susidarė po paskutinio Aukštaitijos ledyno, kuris į šią teritoriją Nevėžio slėniu atslinko prieš 14 tūkst. metų.

Rajono teritorijoje išryškėja trys skirtingo aukščio paviršiai. Aukščiausias yra vakariniame pakraštyje, jo aukštis viršija 100 m (aukščiausias taškas 113 m virš jūros lygio). Didžiausius plotus užima antrasis 60-80 m paviršius. Trečiasis paviršius yra 40-60 m aukščio. Rytiniame pakraštyje virš lygumos iškyla Šėtos-Okainių-Pavermenio moreninis gūbrys.